主角工藤新一原本是一位经常帮助警方破案的17岁高中生侦探，被称为“平成年代的福尔摩斯”、“日本警察的救世主”。某一天和青梅竹马的毛利兰在热带乐园游玩时目击黑暗组织的可疑行动，他因为试图跟踪黑暗组织成员而被偷袭，并被灌下代号为“APTX-4869”的
神秘药物。新一虽然幸免于死，但身体就此缩小为小学一年级时的模样，情急之下化名为江户川柯南，在邻居阿笠博士的建议下，寄住在毛利兰的父亲毛利小五郎家中。同时他凭借著过人的推理能力，以及使用阿笠博士为他发明的各种道具，让小五郎成为全球知名的名侦探，并借由平时的案件调查努力找寻有关黑暗组织的线索。
《名侦探柯南》处处都扣人心弦：丰富多彩的人物，激荡热烈的情感，诡异绝伦的案件手法，缜密细腻的推理过程，大胆奇妙的思路创新……
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